La Plateforme d’Analyses des Ressources MICrobiologiques (PARMIC) ou Centre de Ressources Biologiques «  Environnement-Microbiologie Lyon » (CRB-EML) a été fondée en 2006 suite aux recommandations de l’Institut Ecologie et Environnement (InEE du CNRS) et de l’Université de Lyon 1. Le CRB-EML assure la sauvegarde de collections de micro-organismes principalement issues de travaux d’équipes de recherche lyonnaises. Le CRB assure la pérennité de ces collections et facilite l’accès aux souches selon les autorisations de distribution accordées par les propriétaires. Ces collections proviennent de travaux effectués dans les domaines de l’écologie microbienne (UMR 5557), de l’Observatoire Français des Nocardioses (OFN), du laboratoire national de référence (LNR) des Escherichia coli producteurs de shiga toxines (STEC), et de l’Observatoire de Terrain en Hydrologie Urbaine (OTHU) de la Zone Atelier Bassin du Rhône (ZABR). Les collections présentent, entre autres, des souches de collections internationales, des souches de sols, de milieux aquatiques, milieux urbains, mais également de l’environnement hospitalier et de cas cliniques. Les principaux groupes ou espèces référencés à ce jour appartiennent aux Burkholderia du complexe cepacia, aux genres Aeromonas, Pseudomonas, Agrobacterium, Nocardia, Rhodococcus, Gordonia, et aux groupes des E. coli STEC isolés de l’animal ou de matrices alimentaires. Ces bactéries peuvent être des agents pathogènes de l’homme, des saprophytes, commensaux, mutualistes, et symbiotes. Elles peuvent contribuer aux principaux cycles biogéochimiques comme celui de l’azote dans le cas particulier des bactéries associées aux végétaux. Le CRB est aussi sollicité par d’autres équipes de recherche pour assurer la sauvegarde et distribution de leurs collections.
Le CRB-EML est hébergé au sein de l’Université Lyon 1 par l’UMR5557 Ecologie Microbienne. Il est structuré et géré selon la norme NF S96-900. Il a un comité de direction composé de l’ensemble des chercheurs et enseignants-chercheurs affectés à cette structure. Il possède un soutien en personnel technique permettant le bon fonctionnement des sphères techniques (phénotypage, génotypage, cryo-conservation) de la plateforme ainsi que la formation des visiteurs/utilisateurs des infrastructures. En tant que centre de stockage et distribution de matériels biologiques, cette structure dispose de technologies innovantes permettant de garantir l’identité et la traçabilité des ressources.
Le CRB-EML se veut un appui pour le développement de recherches en microbiologie environnementale et clinique. Il participe à des activités de recherche concernant la description de nouvelles espèces bactériennes, l’exploration de la diversité infra-spécifique et la notion d’espèce en bactériologie en s’appuyant sur des travaux de génomique comparative.
Les souches de la collection (plus de 2000 souches) peuvent être commandées par des laboratoires de recherche publique (voir conditions de mise à disposition) catalogue disponible en ligne. La gestion des stocks de souches est informatisée par un code de publication.
Le CRB-EML participe au projet Biobanques et fait partie du Réseau Français des Centres de Ressources Biologiques "micro-organismes" (FBRCMi) (http://www.fbrcmi.fr/). Il est engagé dans une démarche Qualité visant à obtenir une certification selon les normes ISO 9001 et NF S96-900.